Uno de los principales deportes que se realizan dentro de la comuna San Francisco de Las Núñez es el surf, esto debido a que la playa cuenta con muy buenas olas de la categoría beach break, las cuales son similares a las de la comuna Montañita; Carlos Vera Franco es un instructor que dirige el club de surfista de la comuna Las Núñez, el cual manifestó que a dicha comunidad llegan aficionados de todas partes, ya que la comuna es denominada “el Point de derechas”, olas que son perfectas para practicar dicha actividad y lo cual ayuda a que haya un desarrollo turístico a la localidad.

En la comuna no existe pesca deportiva como tal; existen embarcaciones como las lanchas de pesca, o más conocidas como fibras de pesca, las cuales se usan para pescar en el mar, en un lago o río y dentro de la localidad solo existen embarcaciones para la pesca comercial, ninguna de ellas está destinada para pesca deportiva.

Dentro de la comuna San Francisco de las Núñez se realiza vóley tradicional, el cual es un deporte donde dos equipos se enfrentan sobre un terreno de juego liso separado por una red central, tratando de pasar el balón por encima de la red hacia el suelo del campo contrario, este deporte más lo realizan las personas de entre 20 a 35 años, los cuales se reúnen todas las tardes a jugar en el centro de la comunidad, para esto no existe un campeonato local, simplemente los habitantes lo realizan por diversión.

Dentro de las actividades deportivas que se pueden realizar en la comuna San Francisco de Las Núñez está el ciclismo, esto gracias a que posee el sendero turístico Matapalo, el cual cuenta con una extensión de 4 km, cabe recalcar que esto se debe realizar con la debida precaución, ya que el lugar no cuenta con una señalética adecuada por lo que debe realizarse con un guía.